แนวทางการดำเนินงาน ทำหน้าที่เสมือน อพ.สธ. ให้คำปรึกษา แนะนำ ประสานงานและเชิญชวนให้ท้องถิ่นและโรงเรียนให้ร่วมสนองพระราชดำริสนับสนุนชุมชนและโรงเรียนให้สามารถดำเนินงานฐานทรัพยากรท้องถิ่นและสวนพฤกษศาสตร์โรงเรียนได้อย่างมีประสิทธิภาพ "ทำหน้าที่สื่อกลางระหว่างชุมชน/ท้องถิ่นและมหาวิทยาลัยโดยนำโจทย์จากชุมชนไปดำเนินการวิจัย พัฒนาและบูรณาการตามพันธกิจของมหาวิทยาลัย" บทบาทของศูนย์แม่ข่ายประสานงาน อพ.สธ.มีบทบาทในกิจกรรมที่ 8 กิจกรรมพิเศษสนับสนุนการอนุรักษ์ทรัพยากร ประสานงาน ส่งเสริมและสนับสนุนให้ท้องถิ่น/โรงเรียน สมัครและดำเนินงานงานฐานทรัพยากรท้องถิ่นและสวนพฤกษศาสตร์โรงเรียน "ประสานงานและสร้างความร่วมมือกันกับมหาวิทยาลัยเครือข่าย(ศูนย์ประสานงาน อพ.สธ.ของมหาวิทยาลัย)" "ช่วยตรวจสอบความถูกต้องทางวิชาการ การให้ความรู้ในการสำรวจ เก็บรวบรวมข้อมูล ให้คำแนะนำชุมชน/ท้องถิ่น ตลอดจนสนับสนุนให้ได้รับป้ายฯ และเกียรติบัตรต่อไป"